Afin de garantir à chaque client que le produit vendu est vraiment un produit certifié FSC, un contrôle est nécessaire tout au long de la chaîne de commercialisation, de l'exploitant forestier jusqu'aux fabriquants de produits finis.
Tant qu'un produit certifié FSC transite par des entreprises certifiées FSC, ce produit peut être valorisé comme produit certifié FSC, avec toutes les garanties FSC pour le client suivant. Seules les entreprises certifiées peuvent également apposer une étiquette FSC sur leurs produits certifiés.
Les contrôles chez les entreprises sont effectués par des organismes de certification indépendants qui vérifient si les règles de traçabilité FSC sont bien respecter dans l'entreprise (achats, ventes, stockage, production, ...).
Si tel est le cas, l'entreprise auditée reçoit de l'organisme de certification un certificat FSC CoC (Chain of Custody) avec un numéro unique de certification FSC CoC ainsi qu'un code de licence FSC.